DRUG BINDING INTERFACES MAPPED TO 'Bacillus subtilis'

List of Binding Interfaces
(Click on the entry ID to view details of interfaces and pattern clusters)
(Note that ASSAM search use only 3-12 residue containing patterns)
Filter list by:
DrReposER ID PDB Ligand Organism Macromolecule Pfam Res. Interface HETATM
1B02_A_C2FA281 1b02 C2F

DB11256
(Levomefolic
acid) 		Bacillus subtilis PROTEIN (THYMIDYLATE
SYNTHASE) 		PF00303
(Thymidylat_synt) 		11 ALA A  64
THR A  67
ILE A  93
TRP A  94
TRP A  97
LEU A 158
ASP A 184
LEU A 187
GLY A 188
TYR A 224
ALA A 278
 C2F A 281
1QAO_A_SAMA245 1qao SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Bacillus subtilis ERMC'
METHYLTRANSFERASE 		PF00398
(RrnaAD) 		13 PHE A  12
GLU A  36
GLY A  38
GLY A  40
GLU A  59
ILE A  60
ASP A  61
LEU A  64
ASP A  84
ILE A  85
ASN A 101
PRO A 103
ILE A 106
 SAM A 245
1SBR_A_VIBA501 1sbr VIB

DB00152
(Thiamine) 		Bacillus subtilis YKOF PF07615
(Ykof) 		8 PHE A  15
SER A  16
LEU A  17
ILE A  25
ILE A  28
LYS A  29
THR A  44
THR A  49
 VIB A 501
1SBR_A_VIBA502 1sbr VIB

DB00152
(Thiamine) 		Bacillus subtilis YKOF PF07615
(Ykof)
no annotation 		6 CYS B  86
PHE A 119
ALA A 120
LEU A 121
ILE A 133
SER A 154
 VIB A 502
1SBR_B_VIBB503 1sbr VIB

DB00152
(Thiamine) 		Bacillus subtilis YKOF no annotation 7 PHE B  15
SER B  16
ILE B  25
ILE B  28
LYS B  29
THR B  44
THR B  49
 VIB B 503
1SBR_B_VIBB504 1sbr VIB

DB00152
(Thiamine) 		Bacillus subtilis YKOF PF07615
(Ykof)
no annotation 		6 PRO A  87
PHE B 119
LEU B 121
ILE B 133
SER B 154
HIS A 180
 VIB B 504
1WMQ_A_HISA2001 1wmq HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Bacillus subtilis HUT OPERON POSITIVE
REGULATORY PROTEIN 		PF09021
(HutP) 		6 ARG A  88
ARG A  98
ILE A 129
GLY A 130
ALA A 131
HIS A 138
 HIS A2001
1WMQ_B_HISB1001 1wmq HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Bacillus subtilis HUT OPERON POSITIVE
REGULATORY PROTEIN 		None 6 ARG B  88
ARG B  98
ILE B 129
GLY B 130
ALA B 131
HIS B 138
 HIS B1001
1WPU_A_HISA2001 1wpu HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Bacillus subtilis HUT OPERON POSITIVE
REGULATORY PROTEIN 		PF09021
(HutP) 		6 ARG A  88
ARG A  98
ILE A 129
GLY A 130
ALA A 131
HIS A 138
 HIS A2001
1WPU_B_HISB1001 1wpu HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Bacillus subtilis HUT OPERON POSITIVE
REGULATORY PROTEIN 		None 6 ARG B  88
ARG B  98
ILE B 129
GLY B 130
ALA B 131
HIS B 138
 HIS B1001
1WRQ_A_HISA2001 1wrq HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Bacillus subtilis HUT OPERON POSITIVE
REGULATORY PROTEIN 		PF09021
(HutP) 		6 ARG A  88
ARG A  98
ILE A 129
GLY A 130
ALA A 131
HIS A 138
 HIS A2001
1WRQ_B_HISB1001 1wrq HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Bacillus subtilis HUT OPERON POSITIVE
REGULATORY PROTEIN 		None 6 ARG B  88
ARG B  98
ILE B 129
GLY B 130
ALA B 131
HIS B 138
 HIS B1001
2GLU_A_SAMA301 2glu SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Bacillus subtilis YCGJ PF08241
(Methyltransf_11) 		12 GLY A  20
GLY A  22
HIS A  25
THR A  26
ASP A  41
ALA A  42
THR A  43
THR A  68
ALA A  69
GLU A  70
ARG A  85
HIS A  90
 SAM A 301
2GLU_B_SAMB302 2glu SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Bacillus subtilis YCGJ None 14 GLY B  20
GLY B  22
HIS B  25
THR B  26
ASP B  41
ALA B  42
THR B  43
THR B  68
ALA B  69
GLU B  70
ARG B  85
ALA B  87
HIS B  90
PHE B  91
 SAM B 302
2Q83_A_ADNA1 2q83 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Bacillus subtilis YTAA PROTEIN PF01636
(APH) 		7 ILE A  51
CYS A  70
PRO A  99
TRP A 123
ILE A 124
LEU A 246
ILE A 256
 ADN A   1
2Q83_B_ADNB2 2q83 ADN

DB00640
(Adenosine) 		Bacillus subtilis YTAA PROTEIN no annotation 6 ILE B  51
CYS B  70
PRO B  99
TRP B 123
LEU B 246
ILE B 256
 ADN B   2
3BOY_A_HISA1001 3boy HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Bacillus subtilis HUT OPERON POSITIVE
REGULATORY PROTEIN 		None
PF09021
(HutP) 		10 TYR C  69
HIS C  73
TYR C  76
HIS C  77
ARG A  88
ARG A  98
ILE A 129
GLY A 130
ALA A 131
HIS A 138
 HIS A1001
3BOY_A_HISA2001 3boy HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Bacillus subtilis HUT OPERON POSITIVE
REGULATORY PROTEIN 		None
PF09021
(HutP) 		10 TYR A  69
HIS A  73
TYR A  76
HIS A  77
ARG B  88
ARG B  98
ILE B 129
GLY B 130
ALA B 131
HIS B 138
 HIS A2001
3BOY_A_HISA3001 3boy HIS

DB00117
(L-
Histidine) 		Bacillus subtilis HUT OPERON POSITIVE
REGULATORY PROTEIN 		None
PF09021
(HutP) 		10 TYR B  69
HIS B  73
TYR B  76
HIS B  77
ARG C  88
ARG C  98
ILE C 129
GLY C 130
ALA C 131
HIS C 138
 HIS A3001
3KL3_A_DHIA403 3kl3 DHI

DB00117
(L-
Histidine) 		Bacillus subtilis GLUCURONOXYLANASE
XYNC 		PF17189
(Glyco_hydro_30C) 		4 GLY A 300
TYR A 301
GLY A 321
ASP A 322
 DHI A 403
3KL3_B_DHIB404 3kl3 DHI

DB00117
(L-
Histidine) 		Bacillus subtilis GLUCURONOXYLANASE
XYNC 		None 4 GLU B 140
TYR B 143
TYR B 204
TYR B 231
 DHI B 404
3LM8_A_VIBA223 3lm8 VIB

DB00152
(Thiamine) 		Bacillus subtilis THIAMINE
PYROPHOSPHOKINASE 		PF04263
(TPK_catalytic)
PF04265
(TPK_B1_binding)
no annotation 		7 ASP C  78
THR C  80
TYR A 174
LEU A 176
LEU A 187
SER A 190
ASN A 191
 VIB A 223
3LM8_B_VIBB223 3lm8 VIB

DB00152
(Thiamine) 		Bacillus subtilis THIAMINE
PYROPHOSPHOKINASE 		no annotation 7 THR D  80
TYR B 174
LEU B 176
LEU B 187
CYS B 188
SER B 190
ASN B 191
 VIB B 223
3LM8_C_VIBC223 3lm8 VIB

DB00152
(Thiamine) 		Bacillus subtilis THIAMINE
PYROPHOSPHOKINASE 		PF04263
(TPK_catalytic)
PF04265
(TPK_B1_binding)
no annotation 		8 LYS A  77
ASP A  78
TYR C 174
LEU C 176
LEU C 187
CYS C 188
SER C 190
ASN C 191
 VIB C 223
3LM8_D_VIBD223 3lm8 VIB

DB00152
(Thiamine) 		Bacillus subtilis THIAMINE
PYROPHOSPHOKINASE 		no annotation 8 ASP B  78
HIS B 109
TYR D 174
LEU D 176
LEU D 187
CYS D 188
SER D 190
ASN D 191
 VIB D 223
3PPO_A_DCKA401 3ppo DCK

DB00583
(L-
Carnitine) 		Bacillus subtilis GLYCINE
BETAINE/CARNITINE/CH
OLINE-BINDING
PROTEIN 		PF04069
(OpuAC) 		9 GLN A  39
SER A  71
ASN A  72
TYR A  91
THR A  94
ASN A 135
TYR A 137
TYR A 217
TYR A 241
 DCK A 401
3PPO_B_DCKB401 3ppo DCK

DB00583
(L-
Carnitine) 		Bacillus subtilis GLYCINE
BETAINE/CARNITINE/CH
OLINE-BINDING
PROTEIN 		None 9 GLN B  39
SER B  71
ASN B  72
TYR B  91
THR B  94
ASN B 135
TYR B 137
TYR B 217
TYR B 241
 DCK B 401
3Q5P_A_TACA7101 3q5p TAC

DB00759
(Tetracycline) 		Bacillus subtilis MULTIDRUG-EFFLUX
TRANSPORTER 1
REGULATOR 		PF06445
(GyrI-like)
PF13411
(MerR_1) 		12 PRO A 144
VAL A 147
ASN A 149
TYR A 152
TYR A 170
ILE A 182
TYR A 187
PHE A 224
TYR A 229
GLU A 253
ILE A 255
TYR A 268
 TAC A7101
3Q5R_A_KANA2002 3q5r KAN

DB01172
(Kanamycin) 		Bacillus subtilis MULTIDRUG-EFFLUX
TRANSPORTER 1
REGULATOR 		PF06445
(GyrI-like)
PF13411
(MerR_1) 		11 PRO A 144
VAL A 147
ASN A 149
TYR A 152
TYR A 170
ILE A 182
TYR A 187
PHE A 224
TYR A 229
GLU A 253
ILE A 255
 KAN A2002
3Q5S_A_ACHA1289 3q5s ACH

DB03128
(Acetylcholine) 		Bacillus subtilis MULTIDRUG-EFFLUX
TRANSPORTER 1
REGULATOR 		PF06445
(GyrI-like)
PF13411
(MerR_1) 		6 VAL A 147
ASN A 149
TYR A 152
TYR A 187
GLU A 253
ILE A 255
 ACH A1289
4BZF_B_ACTB502 4bzf ACT

DB03166
(Acetic
acid) 		Bacillus subtilis ALDOSE 1-EPIMERASE None 4 HIS B 101
HIS B 177
ASP B 230
TYR B 271
 ACT B 502
4D7H_A_H4BA902 4d7h H4B

DB00360
(Sapropterin) 		Bacillus subtilis NITRIC OXIDE
SYNTHASE OXYGENASE 		PF02898
(NO_synthase) 		3 ARG A 247
THR A 328
TRP A 329
 H4B A 902
4D9H_A_ADNA301 4d9h ADN

DB00640
(Adenosine) 		Bacillus subtilis PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE
DEOD-TYPE 		PF01048
(PNP_UDP_1)
no annotation 		13 HIS B   4
ARG B  43
MET A  64
ARG A  87
SER A  90
GLY A  92
VAL A 177
GLU A 178
MET A 179
GLU A 180
SER A 202
ASP A 203
VAL A 205
 ADN A 301
4DA6_A_GA2A301 4da6 GA2

DB01004
(Ganciclovir) 		Bacillus subtilis PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE
DEOD-TYPE 		PF01048
(PNP_UDP_1) 		9 MET A  64
SER A  90
GLY A  92
VAL A 177
MET A 179
GLU A 180
SER A 202
ASP A 203
VAL A 205
 GA2 A 301
4DA7_A_AC2A301 4da7 AC2

DB00787
(Aciclovir) 		Bacillus subtilis PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE
DEOD-TYPE 		PF01048
(PNP_UDP_1) 		10 MET A  64
ARG A  87
GLY A  92
ALA A 156
VAL A 177
GLU A 178
MET A 179
GLU A 180
SER A 202
VAL A 205
 AC2 A 301
4DAN_A_2FAA301 4dan 2FA

DB01073
(Fludarabine) 		Bacillus subtilis PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE
DEOD-TYPE 		PF01048
(PNP_UDP_1)
no annotation 		13 HIS B   4
ARG B  43
MET A  64
ARG A  87
SER A  90
GLY A  92
VAL A 177
GLU A 178
MET A 179
GLU A 180
SER A 202
ASP A 203
VAL A 205
 2FA A 301
4DAN_B_2FAB301 4dan 2FA

DB01073
(Fludarabine) 		Bacillus subtilis PURINE NUCLEOSIDE
PHOSPHORYLASE
DEOD-TYPE 		PF01048
(PNP_UDP_1)
no annotation 		12 HIS A   4
ARG A  43
ARG B  87
SER B  90
GLY B  92
VAL B 177
GLU B 178
MET B 179
GLU B 180
SER B 202
ASP B 203
VAL B 205
 2FA B 301
4L6V_1_PQN12001 4l6v PQN

DB01022
(Phylloquinone) 		Bacillus
subtilis;
Synechocystis sp.
PCC 6803 		FUSION PROTEIN OF
PHOTOSYSTEM I
SUBUNIT III AND
SUBUNIT IX;
PHOTOSYSTEM I P700
CHLOROPHYLL A
APOPROTEIN A1 		PF00223
(PsaA_PsaB)
PF01701
(PSI_PsaJ)
PF02507
(PSI_PsaF) 		11 ALA 6  11
TRP 1  49
MET 1 684
PHE 1 685
SER 1 688
GLY 1 689
ARG 1 690
TRP 1 693
ALA 1 717
LEU 1 718
GLY 1 723
 PQN 12001
4L6V_A_PQNA2001 4l6v PQN

DB01022
(Phylloquinone) 		Bacillus
subtilis;
Synechocystis sp.
PCC 6803 		FUSION PROTEIN OF
PHOTOSYSTEM I
SUBUNIT III AND
SUBUNIT IX;
PHOTOSYSTEM I P700
CHLOROPHYLL A
APOPROTEIN A1 		no annotation 9 ALA f  11
TRP a  49
MET a 684
PHE a 685
SER a 688
TRP a 693
ALA a 717
LEU a 718
GLY a 723
 PQN a2001
4LS7_A_1X9A504 4ls7 1X9

DB01034
(Cerulenin) 		Bacillus subtilis 3-OXOACYL-[ACYL-CARR
IER-PROTEIN]
SYNTHASE 2 		PF00109
(ketoacyl-synt)
PF02801
(Ketoacyl-synt_C) 		13 GLY A 107
ILE A 108
ALA A 162
CYS A 163
GLU A 191
SER A 198
PHE A 202
HIS A 302
THR A 304
HIS A 339
LEU A 341
GLY A 397
PHE A 398
 1X9 A 504
4LS7_B_1X9B503 4ls7 1X9

DB01034
(Cerulenin) 		Bacillus subtilis 3-OXOACYL-[ACYL-CARR
IER-PROTEIN]
SYNTHASE 2 		PF00109
(ketoacyl-synt)
PF02801
(Ketoacyl-synt_C)
no annotation 		12 ILE B 108
MET A 137
ALA B 162
CYS B 163
SER B 198
PHE B 202
HIS B 302
THR B 304
HIS B 339
LEU B 341
GLY B 397
PHE B 398
 1X9 B 503
4POO_A_SAMA301 4poo SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Bacillus subtilis PUTATIVE RNA
METHYLASE 		PF06962
(rRNA_methylase) 		14 THR A  28
GLY A  30
ASN A  31
HIS A  33
ASP A  34
ASP A  52
ILE A  53
GLN A  54
SER A  79
HIS A  80
ASN A 101
LEU A 105
THR A 114
SER A 118
 SAM A 301
4POO_B_SAMB301 4poo SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Bacillus subtilis PUTATIVE RNA
METHYLASE 		None 12 THR B  28
GLY B  30
ASN B  31
HIS B  33
ASP B  34
ASP B  52
ILE B  53
GLN B  54
SER B  79
HIS B  80
ASN B 101
SER B 118
 SAM B 301
4UG5_A_H4BA902 4ug5 H4B

DB00360
(Sapropterin) 		Bacillus subtilis NITRIC OXIDE
SYNTHASE OXYGENASE 		PF02898
(NO_synthase) 		3 ARG A 247
THR A 328
TRP A 329
 H4B A 902
4UGL_A_H4BA902 4ugl H4B

DB00360
(Sapropterin) 		Bacillus subtilis NITRIC OXIDE
SYNTHASE 		PF02898
(NO_synthase) 		3 ARG A 247
THR A 328
TRP A 329
 H4B A 902
5EDL_A_VIBA201 5edl VIB

DB00152
(Thiamine) 		Bacillus subtilis PUTATIVE
HMP/THIAMINE
PERMEASE PROTEIN
YKOE 		PF09819
(ABC_cobalt) 		14 TYR A  23
THR A  27
TYR A  42
TYR A  46
TRP A  49
GLU A  70
GLU A  77
VAL A  88
ILE A  91
GLN A  95
ASP A 131
SER A 135
TYR A 137
ARG A 152
 VIB A 201
5G6C_A_H4BA902 5g6c H4B

DB00360
(Sapropterin) 		Bacillus subtilis NITRIC OXIDE
SYNTHASE OXYGENASE 		PF02898
(NO_synthase) 		3 ARG A 247
THR A 328
TRP A 329
 H4B A 902
5OF1_A_SALA301 5of1 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Bacillus subtilis SPORE
COAT-ASSOCIATED
PROTEIN N 		no annotation 5 ALA A  53
VAL A  55
LYS A  68
PHE A  70
ILE A 198
 SAL A 301
5OF1_B_SALB301 5of1 SAL

DB00936
(Salicylic
acid) 		Bacillus subtilis SPORE
COAT-ASSOCIATED
PROTEIN N 		no annotation 5 ALA B  53
VAL B  55
LYS B  68
PHE B  70
ILE B 198
 SAL B 301
5ONL_A_010A302 5onl 010

DB06770
(Benzyl
alcohol) 		Bacillus subtilis YNDL PF05908
(Gamma_PGA_hydro) 		5 GLU A  55
LYS A  58
GLU A  59
GLU A 196
PHE A 199
 010 A 302
5TZO_A_7V7A201 5tzo 7V7

DB00813
(Fentanyl) 		Bacillus subtilis ENDO-1,4-BETA-XYLANA
SE A 		PF00457
(Glyco_hydro_11) 		8 TRP A  63
TRP A  90
THR A  91
TYR A 108
THR A 110
ARG A 112
GLN A 127
TRP A 129
 7V7 A 201
5TZO_A_7V7A202 5tzo 7V7

DB00813
(Fentanyl) 		Bacillus subtilis ENDO-1,4-BETA-XYLANA
SE A 		PF00457
(Glyco_hydro_11) 		14 PHE A   9
SER A  35
VAL A  37
TRP A  63
ALA A  65
TRP A  71
TYR A  80
PRO A 116
ILE A 118
TRP A 129
TYR A 166
ALA A 172
GLY A 173
TYR A 174
 7V7 A 202
5TZO_B_7V7B201 5tzo 7V7

DB00813
(Fentanyl) 		Bacillus subtilis ENDO-1,4-BETA-XYLANA
SE A 		no annotation 15 LEU B   7
PHE B   9
SER B  35
VAL B  37
TRP B  63
ALA B  65
TRP B  71
TYR B  80
ARG B 112
PRO B 116
TRP B 129
TYR B 166
ALA B 172
GLY B 173
TYR B 174
 7V7 B 201
5TZO_B_7V7B202 5tzo 7V7

DB00813
(Fentanyl) 		Bacillus subtilis ENDO-1,4-BETA-XYLANA
SE A 		no annotation 8 TRP B  63
TRP B  90
THR B  91
TYR B 108
THR B 110
ARG B 112
GLN B 127
TRP B 129
 7V7 B 202
5TZO_C_7V7C201 5tzo 7V7

DB00813
(Fentanyl) 		Bacillus subtilis ENDO-1,4-BETA-XYLANA
SE A 		no annotation 14 PHE C   9
SER C  35
VAL C  37
TRP C  63
ALA C  65
TRP C  71
TYR C  80
PRO C 116
ILE C 118
TRP C 129
TYR C 166
ALA C 172
GLY C 173
TYR C 174
 7V7 C 201
5TZO_C_7V7C202 5tzo 7V7

DB00813
(Fentanyl) 		Bacillus subtilis ENDO-1,4-BETA-XYLANA
SE A 		no annotation 8 TRP C  63
TRP C  90
THR C  91
TYR C 108
THR C 110
ARG C 112
GLN C 127
TRP C 129
 7V7 C 202
5ZW4_A_SAMA302 5zw4 SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Bacillus subtilis PUTATIVE
O-METHYLTRANSFERASE
YRRM 		PF01596
(Methyltransf_3) 		18 PRO A  36
ILE A  37
MET A  38
GLU A  60
GLY A  62
ALA A  64
TYR A  67
SER A  68
GLU A  85
ARG A  86
ASN A  87
ARG A  90
ASP A 113
ALA A 114
ASP A 133
ALA A 134
ALA A 135
PHE A 142
 SAM A 302
6EFN_A_SAMA501 6efn SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Bacillus subtilis SPORULATION KILLING
FACTOR MATURATION
PROTEIN SKFB 		PF04055
(SPASM)
PF13186
(Radical_SAM) 		11 TYR A 125
THR A 159
GLU A 162
PHE A 186
SER A 211
ARG A 223
ALA A 249
THR A 251
THR A 280
LEU A 281
ALA A 286
 SAM A 501
6HRJ_A_010A302 6hrj 010

DB06770
(Benzyl
alcohol) 		Bacillus subtilis YNDL PF05908
(Gamma_PGA_hydro) 		5 GLU A  55
LYS A  58
GLU A  59
GLU A 196
PHE A 199
 010 A 302
6IFT_A_SAMA301 6ift SAM

DB00118
(S-
Adenosylmethionine) 		Bacillus subtilis RIBOSOMAL RNA SMALL
SUBUNIT
METHYLTRANSFERASE A 		PF00398
(RrnaAD) 		17 GLN A  28
PHE A  30
LEU A  31
GLU A  54
ILE A  55
GLY A  56
GLY A  58
ALA A  61
GLU A  77
ILE A  78
ASP A  79
LEU A  82
ASP A 102
VAL A 103
ASN A 127
PRO A 129
TYR A 131
 SAM A 301